刪除了舊規(guī)定中“⑤特殊醫(yī)學用途配方食品中添加經(jīng)衛(wèi)生計生委批準的新食品原料等其他物質(zhì)的，應當提供該原料在產(chǎn)品聲稱的適用人群中使用的科學性、合理性和食用安全性依據(jù)，表明該原料食用安全性、營養(yǎng)充足性和特殊醫(yī)學用途臨床效果的科學文獻資料，以及該原料在產(chǎn)品聲稱的適用人群中的食用安全性評價資料。”，“⑥作為非營養(yǎng)成分使用的人工合成色素、防腐劑等食品添加劑應當符合食品安全國家標準的要求，申請人應當結合臨床實際、目標人群的特殊性與產(chǎn)品工藝必要性等情況，提供相應的安全性材料。”

　　增加了“①配方中食品原料、食品輔料、營養(yǎng)強化劑、食品添加劑的種類應符合相應食品安全國家標準和（或）有關規(guī)定，不得添加標準中規(guī)定的營養(yǎng)素和可選擇性成分以外的其他生物活性物質(zhì)。”

　　增加了對食品輔料和營養(yǎng)強化劑的規(guī)定；

　　（3）研發(fā)報告

　　配方篩選過程、適用人群確定依據(jù)、產(chǎn)品標準要求制定過程及技術要求中各指標限量制定依據(jù)等方面明確只針對“特定全營養(yǎng)配方食品和非全營養(yǎng)配方食品”

　　生產(chǎn)工藝研究材料方面，增加“營養(yǎng)素、可選擇性成分控制方案，以及污染物、微生物、真菌毒素等可能含有的危害物質(zhì)的控制方案等。”

　　包裝方面，由“包裝材料和容器選擇依據(jù)，包裝材料和產(chǎn)品的相容性研究資料。”改為“包裝材料和容器中有害物質(zhì)遷移的控制方案。”

　　刪去了“ F.標簽、說明書制定依據(jù)等。”

　　穩(wěn)定性試驗方面，明確只針對“特定全營養(yǎng)配方食品和非全營養(yǎng)配方食品產(chǎn)品注冊”，要求提交穩(wěn)定性試驗報告，提交內(nèi)容刪除了“并附相應的圖譜”的要求。而“特殊醫(yī)學用途嬰兒配方食品和全營養(yǎng)配方食品注冊”要求“組織穩(wěn)定性研究試驗，并保留記錄備查。”，未要求提交穩(wěn)定性報告。增加了“對于已在我國上市銷售的特定全營養(yǎng)配方食品和非全營養(yǎng)配方食品，可提交已有的穩(wěn)定性研究材料，并對穩(wěn)定性結果進行總結。”

　　刪除了“③產(chǎn)品研究合理性和臨床使用必要性的綜述，產(chǎn)品上市獲益與風險的全面評估材料，以及該產(chǎn)品或同類產(chǎn)品生產(chǎn)、上市銷售及使用情況。”

　　3.生產(chǎn)工藝材料

　　調(diào)整了順序，規(guī)范了表達方式。將生產(chǎn)工藝流程圖放到了最后。

　　4.產(chǎn)品標準要求

　　產(chǎn)品技術要求內(nèi)容增加“食品輔料、營養(yǎng)強化劑”的要求，刪除“產(chǎn)品適用人群，保質(zhì)期”及相關規(guī)定“⑦特定全營養(yǎng)配方食品的適用人群應為患有特定疾病且無并發(fā)癥或合并其他疾病的人群。”

　　沒有對應國家食品安全的情況，去掉“無相關食品安全國家標準的，申請人應提供食品原料、食品添加劑質(zhì)量要求及使用依據(jù)。申請人對食品原料、食品添加劑的質(zhì)量安全負責。”改為“進口注冊產(chǎn)品使用的食品原料、食品輔料、營養(yǎng)強化劑、食品添加劑，其質(zhì)量安全標準與食品安全國家標準有差異的，應提供符合食品安全國家標準相關材料。”

　　刪除了“④除上述一般要求外，食品原料、食品添加劑中可能含有的危害成分，應檢測其含量，并在產(chǎn)品標準要求中制定限量指標。”和 “檢驗方法應當具有專屬性并符合準確度和精密度等相關要求。”

　　5.產(chǎn)品標簽、說明書樣稿

　　強調(diào)了“產(chǎn)品標簽、說明書中的產(chǎn)品配方應與注冊批準的內(nèi)容一致”，規(guī)范了表達方式。

　　6.試驗樣品檢驗報告

　　7.研發(fā)、生產(chǎn)和檢驗能力證明材料

　　簡化研發(fā)能力證明材料，為“產(chǎn)品配方設計及其依據(jù)、產(chǎn)品研發(fā)報告等。”

　　簡化生產(chǎn)能力證明材料，分不同情況提交資料，已上市產(chǎn)品提交的材料簡化為“已取得食品生產(chǎn)許可證的境內(nèi)申請人，應提交食品生產(chǎn)許可證復印件（含正本、副本及品種明細）；已取得進口資質(zhì)特殊醫(yī)學用途配方食品的境外申請人，應提交良好生產(chǎn)管理規(guī)范和（或）相應生產(chǎn)質(zhì)量管理體系的證明材料。”

　　取消全部項目自行檢驗能力的限制。調(diào)整檢驗能力證明材料內(nèi)容為“自行檢驗的，應提交檢驗人員、檢驗設備設施、全項目資質(zhì)的基本情況；不具備自行檢驗能力的，應提交實施逐批檢驗的檢驗機構名稱、法定資質(zhì)證明以及申請人與該檢驗機構的委托合同等。”

　　8.臨床試驗報告

　　規(guī)范了表達方式

　　9.與注冊申請相關的證明性文件

　　刪除了“該產(chǎn)品生產(chǎn)企業(yè)符合相應生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范和（或）相應質(zhì)量管理體系的證明材料。”

　　變更注冊申請材料項目與要求的變化

　　總體材料刪除了“4.產(chǎn)品已經(jīng)生產(chǎn)銷售的證明材料或產(chǎn)品未經(jīng)生產(chǎn)銷售的情況說明。”、 “5.變更事項的具體名稱、理由及依據(jù)。”兩項

　　刪除了“1.產(chǎn)品名稱的變更申請，還應提交擬變更后的產(chǎn)品名稱與已經(jīng)批準注冊的藥品、保健食品及特殊醫(yī)學用途配方食品名稱不重名的檢索材料。”

　　明確“變更產(chǎn)品配方中作為非營養(yǎng)成分的食品添加劑、標簽說明書載明的有關事項，生產(chǎn)工藝再優(yōu)化等”時， 僅“申請?zhí)囟ㄈ珷I養(yǎng)配方食品和非全營養(yǎng)配方食品產(chǎn)品變更注冊，按擬變更后條件生產(chǎn)的三批樣品穩(wěn)定性檢驗報告。”

　　延續(xù)注冊申請材料項目及要求的變化

　　明確僅“申請?zhí)囟ㄈ珷I養(yǎng)配方食品和非全營養(yǎng)配方食品產(chǎn)品延續(xù)注冊”，需要提交產(chǎn)品注冊申請時承諾繼續(xù)完成的完整的長期穩(wěn)定性試驗研究材料。

　　穩(wěn)定性研究要求的變化

　　刪除了對“每一種包裝規(guī)格產(chǎn)品均應進行穩(wěn)定性研究。”、“并附相應的圖譜”、“檢驗方法應當具有專屬性并符合準確度和精密度等相關要求”等要求。